ADVANCED METHOD FOR IDENTIFYING АLIVE ORGANISMS IN MARINE ZOOPLANKTON STAINED WITH NEUTRAL RED AND FLUORESCEIN DIACETATE
Keywords:
live and dead zooplankton, mortality, staining, digitizing, neutral red, fluorescein diacetate, discriminant analysisAbstract
In natural zooplankton samples, the intensity of staining specimens with vital dyes varies significantly and, as a result, it is difficult to classify poorly stained organisms exactly to either аlive or dead. If the fraction of the ‘questionable’ organisms in the sample is high, it is impossible to obtain reliable and reproducible results. In this work, a solution of the problem is considered, which is an advanced approach for identifying live/dead organisms in stained samples of mesozooplankton through digitizing their images, averaging their colour (hue) and brightness and, finally, applying discriminant analysis of the colour data obtained for every specimen to classify the latter as live or dead.
References
Губарева Е. С., Светличный Л. С., Ишинибилир М. Распределение живого и мёртвого мезозоопланктона в прибосфорских районах Чёрного и Мраморного морей: солёностная толерантность Acartia clausi и A. tonsa // Морск. экол. журн. – 2008. – 7, № 4. – С. 27 – 39.
Дзицкий В. C. Компьютерная программа ImageRegionColor // Свидетельство про регистрацию авторского права на произведение №36639 от 21.01.2011.
Дзицкий В. C. Компьютерная программа для оценки цветовых характеристик окрашенных зоопланктонных организмов // Понт Эвксинский: Тез. докл.VII Межд. науч.–прак. конф. мол. уч. (Севастополь 24 – 27 мая 2011 г.). – Севастополь, 2011. – С. 98 – 99.
Зелезинская Л. М. Естественная смертность некоторых форм ихтио- и зоопланктона Чёрного моря: Автореф. дисс. … канд. биол. наук. – Одесса, 1966. – 20 с.
Кастальская-Карзинкина М. А. Методика определения живых и отмерших компонентов планктона на фиксированном материале // Тр. лимнолог. ст. в Косине. – 1935. – № 19. – С. 91 – 103.
Коваль Л. Г. Зоо- и некрозоопланктон Чёрного моря. – К.: Наук. думка. 1984. – 128 с.
Литвинюк Д. А., Аганесова Л. О., Муханов В. С. Определение доли живых организмов в культуре копеподы Calanipeda aquaedulcis после их окраски нейтральным красным и диацетатом флуоресцеина // Экология моря. – 2009. – Вып. 78. – С. 65 – 69.
Литвинюк Д. А., Алтухов Д. А., Муханов В. С. Динамика доли живых Сopepoda в планктоне Севастопольской бухты и открытого прибрежья в 2010 – 2011 гг. // Морск. экол. журн. – 2011. – Отд. вып. №2. – С. 56 – 65.
Павлова Е. В., Мельникова Е. Б. Зоопланктон прибрежных вод юго-западного Крыма (1998 - 2006 гг.) // Морск. экол. журн. – 2011. – 10, № 3. – С. 33 – 41.
Семёнова А. C. Индикаторная роль зоопланктона в оценке экологического состояния Куршского залива: Автореф. дисс. … канд. биол. наук. – Борок, 2010. – 20 с.
Bickel S. L., Tang K. W., Grossart H. P. Use of aniline blue to distinguish live and dead crustacean zooplankton composition in freshwaters // Freshwater Biology. – 2008. – 54, № 5. – P. 971 – 981.
Culverhouse P. F., Williams R., Benfield M. Automatic image analysis of plankton: future perspectives // Mar. Ecol. Progr. Ser. – 2006. – 312. – P. 297 – 309.
Dressel D. M., Heinle D. R., Grote M. C. Vital starting to sort dead and live copepods // Chesapeake Sci. – 1972. – 13. – P. 156 – 159.
Dubovskaya O. P. Evaluation of Possible Causes of Non-Predatory Mortality of Crustacean Zooplankton in a Small Siberian Reservoir // J. Siberian Fed. Univ. Biol. – 2008. – 1. – P. 145 – 161
Elliott D. T., Tang K. W. Influence of carcass abundance on estimates of mortality and assessment of population dynamics in Acartia tonsa // Mar. Ecol. Progr. Ser. – 2011. – 427. – P. 1 – 12.
Fleming J. M., Coughlan J. Preservation of vitally stained zooplankton for live/dead sorting // Estuaries. – 1978. – 1. – P. 135 – 137.
Onji M., Sawabe T., Ezura Y. An evaluation of viable dyes suitable for marine phytoplankton // Bull. Fac. Fish. Hokkaido Univ. – 2000. – 51, 3. – P. 153 – 157.
Sieracki C. K, Sieracki M. E., Yentsch C. S. An imaging-in-flow system for automated analysis of marine microplankton // Mar. Ecol. Prog. Ser. – 1998. – 168. – P. 285 – 296.
Tang K. W., Freund C. S., Schweitzer Ch. L. Occurrence of copepod carcasses in the lower Chesapeake Bay and their decomposition by ambient microbes // Estuar. Coast. Shelf Sci. – 2006. – 68. – P. 499 – 508.
Weikert H. Copepod carcasses in the upwelling region south of Cap Blanc, N.W. Africa // Marine Biology. – 1977. – 42. – P. 351 – 355.
Wheeler E. H. Copepod detritus in the deep sea // Limnol. Oceanogr. – 1967. – 12. – P. 697 – 702.
